Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Kcns1O35173 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcns1O35173 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kcns1O35173 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcns1O35173 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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