Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ArxO35085 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ArxO35085 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ArxO35085 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ArxO35085 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ArxO35085 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ArxO35085 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ArxO35085 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ArxO35085 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ArxO35085 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms