Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms