Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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