Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm11236J3QMS7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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