Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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H2-M1F7CXU4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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