Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms