Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms