Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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BC067074F6RXI4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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BC067074F6RXI4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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