Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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