Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Urb2E9Q7L1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms