Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms