Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms