Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd1E9Q3H4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms