Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms