Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms