Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp839E9PUU5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp839E9PUU5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms