Protein–RNA interactions for Protein: E0CXS8

Gm8113, Predicted gene 8113, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8113E0CXS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8113E0CXS8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms