Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm3543D3Z235 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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