Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms