Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfap1aC0HKD8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfap1aC0HKD8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms