Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms