Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms