Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc8B2RUS7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms