Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms