Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rrn3B2RS91 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms