Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms