Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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