Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms