Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabreA2AMW3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabreA2AMW3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms