Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AI481877A2ALV5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AI481877A2ALV5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AI481877A2ALV5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms