Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn6A2AJB9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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