Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Carm1Q9WVG6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Carm1Q9WVG6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms