Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni1Q9WUZ5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms