Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms