Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms