Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms