Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nphs1Q9QZS7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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