Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms