Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms