Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

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Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PolkQ9QUG2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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PolkQ9QUG2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PolkQ9QUG2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PolkQ9QUG2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PolkQ9QUG2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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