Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CubnQ9JLB4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms