Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms