Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nova1Q9JKN6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms