Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms