Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms