Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms