Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfip11Q9ERA6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfip11Q9ERA6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfip11Q9ERA6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms