Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms