Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Med29Q9DB91 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Med29Q9DB91 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms